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維護氣壓力，為了避免呈現微漏，爐內維護氣應堅持必定的正壓，如果是氫氣維護氣，一般要求20kBar以上。退火氣氛：一般都是選用純氫作為退火氣氛，氣氛純度建議是99.99%以上，如果氣氛中另一部分是惰性氣體的話，純度也可以低一點，可是肯定不能含有過多氧氣、水汽。退火溫度(退火溫度為引物，和模板結合時候的溫度參數，當50%的引物和互補序列，表現為雙鏈DNA分子時的溫度，它是影響PCR特異性的較重要要素。在抱負狀況下，退火溫度足夠低，以確保引物同意圖序列有用退火，一起還要足夠高，以削減非特異性結合。合理的退火溫度從55℃到70℃。退火溫度一般設定比引物的Tm低5℃。大型法蘭處理一般是采納固溶熱處理。

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